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PM小鼠模型構(gòu)建

簡要描述:點突變(PM)小鼠模型通過在特定基因中引入單核苷酸改變(如錯義突變、無義突變),精準(zhǔn)模擬人類遺傳病突變(如腫瘤驅(qū)動突變、代謝疾病相關(guān)SNP),是研究基因功能細(xì)微調(diào)控和藥物開發(fā)的理想工具

  • 更新時間:2025-06-26 17:14:13
  • 訪  問  量:14

詳細(xì)介紹

一、PM小鼠模型構(gòu)建技術(shù)路線選擇

方法

周期

精度

適用場景

CRISPR-Base Editing

2-3個月

單堿基

C→T或A→G轉(zhuǎn)換(無需DSB)

CRISPR-HDR

3-5個月

任意突變

需設(shè)計ssODN供體

ES細(xì)胞同源重組

6-12個月

最高

復(fù)雜突變(如大片段替換+點突變)




二、PM小鼠模型構(gòu)建CRISPR-HDR方案(當(dāng)前常用)

1. 靶點設(shè)計與工具選擇

  • gRNA設(shè)計

    • 靶向突變位點附近(距離<10 bp),使用Benchling優(yōu)化特異性。

    • 推薦工具

      • 單堿基編輯:ABE8e(A→G)或BE4max(C→T)編輯器。

      • HDR修復(fù):高保真Cas9(如HiFi Cas9) + 化學(xué)修飾ssODN供體。

2. ssODN供體設(shè)計

5'同源臂 40-60nt

目標(biāo)突變+沉默突變*

3'同源臂 40-60nt

  • 沉默突變:在PAM序列或gRNA靶區(qū)引入1-2      bp沉默突變(防止供體重切)。

  • 化學(xué)修飾:3'端硫代磷酸酯化(增強穩(wěn)定性,IDT可合成)。

3. 受精卵注射

  • 注射混合物

    • Cas9 mRNA (50 ng/μL) + gRNA (25 ng/μL) + ssODN (100 ng/μL)。

  • 胚胎處理

    • 注射后培養(yǎng)至囊胚期,移植至假孕母鼠。

4. 基因型鑒定

  • 初篩PCR:擴增含突變位點的片段(引物距突變位點>50 bp)。

  • 深度測序

    • 使用ICE工具分析NGS數(shù)據(jù),計算HDR效率。

    • 敏感方法:ddPCR檢測低頻突變(<1%)。

5. 品系建立與驗證

  • 傳代驗證:F0可能為嵌合體,需與野生型交配獲得穩(wěn)定遺傳。

  • 功能驗證

    • 蛋白質(zhì)印跡(檢測突變蛋白表達)。

    • 酶活檢測(如代謝酶突變需測活性)。




三、ES細(xì)胞打靶方案(超高精度)

1. 靶向載體構(gòu)建

  • 同源臂設(shè)計:5'和3'臂各1.5-2 kb,中間含目標(biāo)突變。

  • 篩選標(biāo)記

    • 正選擇:NeoR(后續(xù)可通過Flp刪除)。

    • 負(fù)選擇:DTA(減少隨機整合)。

2. ES細(xì)胞篩選與驗證

  • 陽性克隆鑒定

    • 長片段PCR(擴增整個重組區(qū)域)。

    • Sanger測序確認(rèn)突變位點。

3. 小鼠制備

  • 通過囊胚注射獲得嵌合體,與Flp deleter小鼠交配刪除NeoR。




四、Base Editing方案(無DSB風(fēng)險)

1. 系統(tǒng)選擇

  • C→T突變:用BE4max + gRNA(靶向C在窗口4-8位)。

  • A→G突變:用ABE8e + gRNA(靶向A在窗口4-7位)。

2. 效率優(yōu)化

  • 注射濃度

    • BE4max mRNA (100 ng/μL) + gRNA (50 ng/μL)。

  • 胚胎基因型

    • 需檢測旁系編輯(預(yù)測工具:BE-Hive)。




五、經(jīng)典案例解析

突變類型

疾病模型

構(gòu)建方法

BRAF V600E

黑色素瘤

CRISPR-HDR + ssODN

TP53 R175H

Li-Fraumeni綜合征

ES細(xì)胞同源重組

CFTR ΔF508

囊性纖維化

Base Editing (C→T)




六、常見問題與解決

問題

原因

解決方案

HDR效率低

ssODN穩(wěn)定性不足

使用硫代磷酸酯修飾ssODN

嵌合體突變丟失

生殖系未傳遞

增加F0交配數(shù)量,篩選生殖系傳遞后代

非預(yù)期旁系突變

Base Editing脫靶

選擇高特異性gRNA,驗證全基因組脫靶

 


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